Fehérje molekulatömeg kalkulátor

Szerző: Henrick Yau
- July 21, 2026
| |

Fehérje molekulatömeg kalkulátor

0
Érvényes

A fehérje molekulatömegét az aminosav-maradékok átlagos izotóptömegének összegével számoljuk:

\[ MW = \sum (n_i \times MW_i) - (n_{peptid} \times MW_{H_2O}) \]

Ahol:

  • \(n_i\) = Az egyes aminosavak száma a szekvenciában
  • \(MW_i\) = Az egyes aminosavak molekulatömege
  • \(n_{peptid}\) = A peptidkötések teljes száma
  • \(MW_{H_2O}\) = Egy vízmolekula molekulatömege (18,02 Da)

Mi az a fehérje molekulatömeg-kalkulátor?

A fehérje molekulatömeg-kalkulátor segít meghatározni egy fehérje molekulatömegét az aminosav-szekvenciája vagy összetétele alapján. Emellett további tulajdonságokat is kiszámít, mint például az elméleti izoelektromos pont (pI), extinkciós koefficiens, hidrofobicitás (GRAVY-pontszám) és nettó töltés pH 7-en.

Hogyan használjuk a kalkulátort

A kalkulátor többféle módszert kínál a fehérjeadatok megadására:

  • Szekvencia módszer: Adja meg a fehérjeszekvenciát egybetűs aminosavkódokkal.
  • Összetétel módszer: Manuálisan adja meg az egyes aminosavak számát.
  • Haladó beállítások: Alkalmazzon módosításokat, például acetilációt, diszulfidhidakat vagy terminális módosításokat.

Főbb jellemzők

  • Molekulatömeg kiszámítása Daltonban (Da) és kilodaltonban (kDa).
  • Elméleti pI meghatározása az aminosavak pKa-értékei alapján.
  • Extinkciós koefficiens kiszámítása UV-abszorpcióhoz 280 nm-en.
  • Hidrofobicitás becslése a GRAVY-pontszám segítségével.
  • Egyedi módosítások figyelembevétele, mint a foszforiláció, metiláció és amidáció.

Miért fontos a fehérje molekulatömege?

A fehérje molekulatömegének ismerete elengedhetetlen a következőkhöz:

  • Elektroforézis-elemzés (SDS-PAGE, Western blot).
  • Tömegspektrometriás azonosítás.
  • Fehérjetisztítás és kromatográfia.
  • Szerkezeti és funkcionális vizsgálatok.

Gyakran ismételt kérdések

Hogyan számoljuk ki az elméleti pI-t?

Az izoelektromos pont (pI) az a pH, ahol a fehérje nettó töltése nulla. Kiszámítása a Henderson-Hasselbalch egyenlettel történik:

\[ pI = \frac{pKa_{poz} + pKa_{neg}}{2} \]

Mi az extinkciós koefficiens?

Az extinkciós koefficienst a triptofán (W), tirozin (Y) és cisztein (C) maradékok száma alapján számoljuk:

\[ \varepsilon = (n_W \times 5500) + (n_Y \times 1490) + (n_C \times 125) \]

Hogyan kezeli a kalkulátor a módosításokat?

A kalkulátor lehetővé teszi különböző poszt-transzlációs módosítások alkalmazását, amelyek hozzáadódnak vagy kivonódnak a fehérje molekulatömegéből.

Mi az a GRAVY-pontszám?

A Grand Average of Hydropathy (GRAVY) pontszám a fehérje hidrofobicitásának mértéke. Kiszámítása a következő:

\[ GRAVY = \frac{\sum (Hidropátia_{AA} \times n_{AA})}{Összes\ aminosav} \]

Miért szerepel a vízmolekula a számításban?

Minden peptidkötés kialakulásakor egy vízmolekula távozik, így a teljes tömeget ennek megfelelően korrigáljuk.

Következtetés

A fehérje molekulatömeg-kalkulátor értékes eszköz a biokémia és molekuláris biológia kutatói és hallgatói számára. Akár fehérjeszerkezetet elemez, kísérleteket végez, vagy eredményeket értelmez, ez az eszköz gyorsan és pontosan biztosítja az alapvető molekuláris tulajdonságokat.